Simple and robust sex determination in papaya (Carica papaya L.) cultivars using SCAR marker (https://doi.org/10.17221/145/2023-HORTSCI)

ELECTRONIC SUPPLEMENTARY MATERIAL (ESM)
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Query: ___PAP01_T12-FP_E08.ab1 CO 7 T12 sequence Query ID: lcl|Query_6757 Length: 821


>___PAP02A_T12-FP_C11.ab1 CO 8 T12 sequence
Sequence ID: Query_6759 Length: 817
Range 1: 10 to 817

Score:1435 bits(777), Expect:0.0, 
Identities:804/815(99%),  Gaps:9/815(1%), Strand: Plus/Plus

Query  7    CATCTTCTATCTCTAATGATTTAGGTCAGGAGAGGAGTCTTATGACATTCTATTATACCC  66
            ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  10   CAT-TTCTATCTCT-ATGATTTAGGTCAGGAGAGGAGTCTTATGACATTCTATTATACCC  67

Query  67   ATT-CAAGTTCCACTACACTTTCTAAGTTTCGTGTAACCCTAACACTCATATTCAAGGGA  125
            |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  68   ATTAAAAGTTCCACTACACTTTCTAAGTTTCGTGTAACCCTAAGACTCATATTCAAGGGA  127

Query  126  TGTGTCCTAGAATCGTGCTCTGATACCACCTGTCGTGGCCCGCTCCCTCTTTTTCTGGTG  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  TGTGTCCTAGAATCGTGCTCTGATACCACCTGTCGTGGCCCGCTCCCTCTTTTTCTGGTG  187

Query  186  CATGTCTGGAGCACACTAACACTTTACACTTAATAAATAATAAAAATTAACTTTAATTAA  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  CATGTCTGGAGCACACTAACACTTTACACTTAATAAATAATAAAAATTAACTTTAATTAA  247

Query  246  TATACAGAGTATGCAGAAGCGCTACATCCCTTGAATAATGTACATCAGCTATAATACAAT  305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  TATACAGAGTATGCAGAAGCGCTACATCCCTTGAATAATGTACATCAGCTATAATACAAT  307

Query  306  ATGAGATTCTAAAAttttttcttttttACAATACAAAAGTACAAACTAGTAACATGATCT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  ATGAGATTCTAAAATTTTTTCTTTTTTACAATACAAAAGTACAAACTAGTAACATGATCT  367

Query  366  CTAACTTCTCACTTTGGTTCACATATTATTTTGCAGGGGAATCCTCATTATCTGAAAATG  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  CTAACTTCTCACTTTGGTTCACATATTATTTTGCAGGGGAATCCTCATTATCTGAAAATG  427

Query  426  ATGGGAGAATGAGATATACTATCCCAGTAAGCAAATATTATGACAACACAACTAATACAT  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  428  ATGGGAGAATGAGATATACTATCCCAGTAAGCAAATATTATGACAACACAACTAATACAT  487

Query  486  GAAATATATATCGCTTTCACACACATCAAACATATATATATGATACACTTTTCTTGAAAA  545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  GAAATATATATCGCTTTCACACACATCAAACATATATATATGATACACTTTTCTTGAAAA  547

Query  546  CATATTCACTTTCACTGAAAACAGATGCACAGTCAGAAACAAAAATAAGAATAATGATTC  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  CATATTCACTTTCACTGAAAACAGATGCACAGTCAGAAACAAAAATAAGAATAATGATTC  607

Query  606  AAAAAACACATTACTGCATTGTATAATGCGCTACACTCTTGCATGTACCAATGACTTAAC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  AAAAAACACATTACTGCATTGTATAATGCGCTACACTCTTGCATGTACCAATGACTTAAC  667

Query  666  AGGTACAATGCCCCACATTGTACAATGAGTCACATGTTCTAGAATTAGAAAACAGATGCA  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  AGGTACAATGCCCCACATTGTACAATGAGTCACATGTTCTAGAATTAGAAAACAGATGCA  727

Query  726  CTTCGTTATATTGTACAAATGAGCTCCACTTTATCACAATTATGGAGGGCCATTCACAAT  785
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  728  CTTCGTTATATTGTAC-AATGAGCTCCACTTTATCACAATTATGGAGGGCCATTCACA-T  785

Query  786  CTTTCCAAACTATCATGCAATGCTTACACA-ACCA  819
            ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct  786  CTT-CCAA-CTATCATGCA-TGCTTACACACACCA  817